微生物实验室采用各种灭菌方法，以确保消除设备、培养基和废物中的微生物。最常用的方法是高压灭菌，它利用加压蒸汽实现热应力。其他方法包括辐射灭菌、干热灭菌、过滤灭菌、气体灭菌、蒸汽灭菌和液体灭菌。
高压灭菌：
高压灭菌器是微生物实验室的主要灭菌工具。其功能类似于高压锅，利用高压蒸汽将温度升高到至少 121°C。这种高温加上 15 PSI 的最低压力，可维持至少 15 分钟，以确保即使是最耐高温的微生物也能灭活。高压灭菌可有效灭菌培养基、试剂、设备和生物危险废物。辐射灭菌：
这种方法是利用紫外线（UV）或其他形式的辐射来杀死或灭活微生物。紫外线辐射在消毒方面特别有效，通常用于实验室表面和少量液体的消毒。
干热灭菌：
干热灭菌是在烤箱中将物品加热至高温。这种方法很有效，但与高压灭菌相比，需要更高的温度（通常高于 160°C）和更长的暴露时间。它适用于不能沾水的材料或玻璃器皿和金属器械的灭菌。过滤灭菌法：
过滤用于对热敏感液体的灭菌，如含有酶或其他易变成分的培养基或溶液。孔径小到足以捕获微生物的膜过滤器用于去除细菌、病毒和其他污染物。
气体灭菌：
环氧乙烷灭菌是一种常用的气体灭菌方法，适用于不能承受高温或潮湿的医疗器械。这种方法是将物品暴露在环氧乙烷气体中，环氧乙烷能有效杀死微生物，但由于其易燃性和潜在毒性，需要小心处理。
