生物质能源的成本效益主要体现在大规模利用或使用废料作为原料时。然而，气体净化和调节的投资成本高、能量密度低、工厂建设需要大量空间等挑战影响了其整体成本效益，尤其是在较小规模的情况下。
大规模运营和废物利用：
生物质能源技术，尤其是生物质燃烧技术，在市场上可以买到，对投资者来说风险很小。如果使用废料作为原料，则具有经济竞争力。从几百到几千兆瓦时的大规模运营，由于相关设备的有效性（通常是从石油工业改造而来），可实现经济上的可持续性。小规模运营面临的挑战：
就生物质气化而言，与基于化石的工艺相比，在较小规模上实现成本效益具有挑战性。与气体净化和调节相关的高成本会影响投资成本 40% 以上。此外，该技术需要针对生物质合成气进行特殊调整，这就需要进一步开展研发，以提高气化灵活性和工艺强度。
能量密度和空间要求：
与化石燃料相比，生物质的能量密度较低，部分原因是其含水量较高，导致转化过程中的能量损失。生物质发电厂的建设也需要大量空间，因此很难在土地成本高、生产力有限的城市地区建立此类设施。研发需求：
亟需开展研发活动，以提高生物质能源的成本效益。这包括改进农业实践和育种工作，以稳定原料成本，并开发专门针对生物质合成气的解决方案。这些进步可使生物质能源更符合依赖短供应链的分散式生产模式。
