尽管热解油具有作为可再生能源的潜力，但它面临着阻碍其广泛使用的几个重大挑战。这些挑战包括长期不稳定性、化学反应性以及与现有石油基础设施的不兼容性。
不稳定性和化学反应性：
热解油由中间反应分解产物组成，这使其本身具有不稳定性。随着时间的推移，它将发生变化，最明显的变化是由于其活性成分的冷凝反应而导致粘度增加。这种老化过程还会导致相分离，使其储存和使用更加复杂。将油加热到 100 °C 以上的温度会导致快速反应，形成固体残留物和馏分油，其效用不如原始液态油。与石油基础设施不相容：
热解油与石油有很大不同。它不能与石油混溶，含氧量高达 40%（按重量计），热值较低。它还呈酸性，加热时不稳定，密度比水大。这些特性使它与现有的石油基础设施不兼容，因此必须对其进行重大改造或使用全新的系统。
腐蚀性和低热值：
热解油中氧官能团的复杂混合物导致其腐蚀性强、热值低。这些氧官能团需要通过脱氧工艺去除，如催化加氢脱氧（HDO）。然而，这些过程都是能源密集型的，并且需要氢气，因此生物质生物油的整体生产在工业规模上的经济可行性较低。利用挑战：
由于热解油的含氧化合物成分复杂，其利用具有挑战性。虽然它有可能在固定应用中替代传统燃料油，但需要针对每种应用仔细定义其质量参数。将热解油升级为碳氢化合物燃料或将其用于化学和材料生产需要额外的加工，这增加了复杂性和成本。
