ATR 傅立叶变换红外光谱（衰减全反射傅立叶变换红外光谱）的局限性包括吸收峰强度的波长依赖性、由于折射率的异常分散而导致的峰值向一阶微分形式变形，以及该方法的定性性质限制了其在定量分析中的应用。
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吸收峰强度的波长依赖性:在 ATR 傅立叶变换红外光谱仪中，有效路径长度取决于波长，从而导致相对波段强度的变化。这种依赖性可能导致测量光谱的变化，而这种变化不是由于样品成分的变化，而是由于光谱采集方法本身。这就需要对数据进行仔细解读，有时还需要进行其他傅立叶变换红外光谱仪不需要的额外校正或考虑。
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异常色散导致的峰变形:ATR 方法会导致峰值变形，尤其是无机样品和其他高折射率样品。这种变形表现为吸收峰向一阶差分形式的移动。这种效应是由于折射率的异常分散造成的，它会改变光谱特征的形状和位置，使光谱的解释变得复杂，并可能导致化学物种或官能团的错误识别。
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定性性质:ATR 傅立叶变换红外光谱主要是一种定性分析技术。虽然它可以提供有关材料表面成分和结构的详细信息，但通常不用于定量分析。这一局限性限制了它在需要对成分进行精确定量的情况下的适用性，例如在某些制药或法医应用中。
这些局限性凸显了在解释结果时了解 ATR 傅立叶变换红外技术的基本原理和潜在缺陷的重要性。尽管存在这些挑战，ATR 傅立叶变换红外光谱仍是一种宝贵的表面分析工具，特别是在有机化学和材料科学领域，因为它能够直接分析粉末样品，而无需复杂的样品制备。
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